陆风在行动之中逐渐认识到军统内部的黑暗和对权力利益的纷争,在经历恩师背叛和亲人被杀之后,弃暗投明加入中国共产党,成为中共地下党在军统内部的卧底。他与组织紧密配合,与敌人展开智慧与勇气的较量,布置一个个精巧的圈套和陷阱,经历爱情、亲情和友情的洗礼,为抗战的最终胜利赢得转机。这次《扫毒3》也回归到第一部三雄鼎立的模式,它并不埋藏编织“谁是卧底”的谜题,而是开门见山,采用闪回记忆式的叙事结构,且双线并行,一边是警察好友在卧底任务中相逢联手,一边是毒枭带领兄弟在金三角东山再起,以此深入命悬一线的警匪角逐故事。